El desarrollo continuo del Programa de la Maestría en Ingeniería Alimentaria está avalado por las líneas de investigación-desarrollo llevadas a cabo en la Facultad de Ingeniería Química, siendo estas las siguientes:

1. Desarrollo y aplicación de técnicas modernas de análisis de procesos para el diseño, optimización y evaluación de líneas tecnológicas y empresas alimentarias para su desarrollo o perfeccionamiento.

2. Métodos y técnicas de conservación y procesamiento de alimentos.

3. Extracción y/o recuperación y aplicación de compuestos a partir de tejidos vegetales y residuos agroindustriales.

4. Aplicación de la ingeniería de la calidad higiénico-sanitaria en procesos de elaboración de alimentos Asimismo, podrán considerarse otras líneas desarrolladas en centros con los que se mantengan relaciones de colaboración.