Las investigaciones están organizadas en proyectos priorizándose en el orden siguiente: los que responden a Programas Nacionales de Ciencia y Técnica, Ramales, Territoriales y Empresariales, y tributando a esta misma prioridad la CUJAE ha definido tres programas hacia los cuales debemos orientar estratégicamente nuestras investigaciones, ellos son:
    - Tecnologías de la Información y las Comunicaciones
    - Medio Ambiente y Energía
    - Ciencias de la Vida y Nanotecnología

Las líneas de investigación de la Facultad que tributan a esos programas son:
    -Integración del Sistema de Dirección de la Empresa.
    -Impacto de la capacitación.
    -Inteligencia Organizacional.
    -Calidad.
    -Gestión de Recursos Humanos.
    -Logística y Gestión de la Producción.
    -Tecnologías cuantitativas para la mejora de procesos.

Se ha podido identificar entre las líneas de la Facultad proyectos específicos que tributan directamente a los Programas estratégicos de la CUJAE como los relacionados con la Línea de Informática empresarial, la de Comercio electrónico, la Gestión universitaria, la Gestión ambiental, la Ergonomía y la salud y el de Gestión de la I+D en el Centro de Inmunología Molecular. Además se desarrollan un grupo de proyectos a través de la colaboración internacional a los cuales se les ofrece gran prioridad porque son los que permiten la superación y actualización internacional de los profesores en las líneas antes definidas y la difusión de nuestros resultados.

En la Facultad tenemos un Centro de Estudios de Técnicas de Dirección que tiene contemplado en su misión apoyar a un grupo de Organismos de la Administración Central del Estado en el Desarrollo de la Planeación Estratégica se asesoran 8 organismos centrales (MINAZ, INRH, MTSS, Aduana. MICONS, CIMEX, CUBALSE, MINIL Y MINBAS) respondiendo por ello ante la Comisión Nacional de Cuadros.

Una Facultad de Ingeniería Industrial baluarte de la Revolución por su participación activa en el desarrollo de nuestra sociedad socialista y de otros pueblos; modelo de excelencia para Latinoamérica y profesionalidad de su claustro, estudiantes y egresados, el impacto de sus resultados científicos técnicos, la universalización de su enseñanza y la formación continua de profesionales; que desarrolla sus procesos de gestión con gran integración, informatización y competencia.

Bienvenido a la Facultad de Ingeniería Industrial del Instituto Superior Politécnico "José Antonio Echeverría".

La carrera de Ingeniería Industrial que comienza en 1961, hoy evaluada de Excelencia, prepara profesionales cuya función es la de conductor de procesos de cambios en toda la cadena del valor suministros (transportación-producción-venta-servicios de posventa). También estudia las interrelaciones que se presentan entre los recursos humanos, financieros, equipamiento, materiales, energéticos y de información, con el objetivo de lograr el máximo rendimiento y competitividad de cualquier organización, optimizando sus procesos mediante la planificación, organización, conducción y control. Este Ingeniero está preparado para trabajar en el diagnóstico organizativo, como consultor de procesos de reestructuración empresarial, implementación de diseño logístico, calidad total, gestión de proyectos y de recursos humanos, diseño del trabajo, y otras funciones de investigación-proyección.
En cuanto a la superación profesional, la Facultad oferta diversos programas: los Tutoriales de Doctorado en Ciencias Técnicas, en las especialidades de Ingeniería Industrial y los de Maestrías en: Dirección, Gestión de Recursos Humanos (acreditada nacionalmente), Calidad Total, así como Informática Empresarial y Logística y Gestión de Producción. Además se imparten Diplomados, Cursos, Entrenamientos, Talleres, Seminarios, en el ámbito nacional e internacional sobre temáticas afines a las líneas de investigación.

La preparación académica de los futuros egresados de esta Facultad incluye, como elemento esencial, la dedicación de una parte importante del tiempo a la ejecución de prácticas laborales y trabajos de investigación que permiten una mejor asimilación de los conocimientos y un mayor desarrollo de los hábitos y habilidades necesarios para su formación como ingeniero.

La actividad de ciencia e innovación tecnológica constituye un pilar fundamental del trabajo del Instituto Superior Politécnico José Antonio Echeverría, a la cual se vinculan los profesores, investigadores y técnicos, teniendo un carácter masivo la participación estudiantil.

Su Consejo Científico es el máximo encargado de analizar la política investigativa del Centro a largo plazo, además de evaluar su desarrollo y logros en cada año. También vela por la formación académica, avala la calidad de sus resultados científicos y asesora a la Dirección en aspectos relacionados. Esta estructura se repite a nivel de las Facultades y Centros.

La Cujae participa activamente en los Programas nacionales, ramales y territoriales de ciencia y tecnología que responden a los temas de mayor prioridad para el país, así como incrementa su relación con las empresas cubanas, extranjeras y mixtas radicadas en la Isla, todo lo cual permite un apreciado intercambio, además de una rápida y eficaz aplicación de los resultados de las investigaciones.

Esta esfera de trabajo está organizada en grupos de investigación por temáticas específicas, tributando, a nivel central, a los variados programas multidisciplinarios, que requieren de esfuerzos mancomunados, tales como los dedicados al Desarrollo Sostenible y Medio Ambiente, Biotecnología, Bioinformática, Gestión Tecnológica Hospitalaria, Gestión de Mantenimiento e Ingeniería de Vibraciones, Biosensores, Eficiencia Energética y Renovable, Turismo y Vivienda, Nuevas Tecnologías de la Información, Azúcar, Técnicas de Dirección y Desarrollo de Software, entre otros.

En esta Universidad, los Centros de Investigación y Estudios (12 hasta el momento, asociados casi en su totalidad a las Facultades) constituyen el núcleo de excelencia del trabajo científico, donde se agrupan los colectivos de resultados más relevantes y de mayor envergadura. Ellos son:

• Centro de Investigaciones y Pruebas Electro-energéticas, CIPEL.
• Centro de Investigaciones Hidráulicas, CIH.
• Centro de Investigaciones de Microelectrónica, CIME.
• Centro de Estudios de Ingeniería de Sistemas, CEIS.
• Centro de Estudios de Técnicas de Dirección, CETDIR.
• Centro de Estudios de Tecnologías Energéticas Renovables, CETER.
• Centro de Estudios de Ingeniería de Procesos, CIPRO
• Centro de Estudios de Innovación y Mantenimiento, CEIM.
• Centro de Construcción y Arquitectura Tropical, CECAT.
• Centro de Referencia para la Educación de Avanzada, CREA.
• Centro de Estudios Urbanos de la Habana, CEUH.
• Centro de Colaboración académica CETA-UPV.

Del mismo modo se suma a la lista, atendido directamente por Investigaciones y Postgrados, el Centro de Colaboración Académica, CETA-UPV (Universidad Politécnica de Valencia), que tiene como misión, canalizar y gestionar las actividades de ayuda e intercambio en el marco académico e institucional, entre entidades , así como extender sus resultados a otras universidades cubanas e Iberoamericanas, a través de los cursos de Nivel Avanzado (de Excelencia docente) y programas de Innovación educativa, basado en la utilización de las TIC.

Como parte integral del proceso educativo, existen también los grupos estudiantiles de trabajo científico, quienes estrechamente ligados a los de Investigación, obtienen, en ocasiones, resultados tan importantes que son aplicados directamente a la industria nacional. Anualmente se convocan las jornadas científicas de estudiantes donde se exponen los resultados en este rubro.

Asimismo, al amparo de programas internacionales y convenios de colaboración se realizan investigaciones conjuntas con varios países, destacándose las que se ejecutan con instituciones de Bélgica, Alemania, España, Brasil y México.

El acontecimiento de más relevancia en esta área, es la Conferencia Científica de Ingeniería y Arquitectura, que con carácter internacional es organizada, a finales de noviembre, cada 2 años desde 1977. Otras actividades en este sentido son auspiciadas por las Brigadas Técnicas Juveniles, BTJ y la Asociación Nacional de Innovadores y Racionalizadores, ANIR. La primera agrupa a los investigadores más jóvenes del Instituto, mientras la segunda a los trabajadores que desarrollan ideas e iniciativas para elevar la eficiencia o calidad de sus labores.

Los resultados de las investigaciones son divulgados a través de diferentes perfiles editoriales nacionales e internacionales, además se insertan y son tratados en las seis revistas que posee la Cujae, hace más de 20 años: Arquitectura, Ingeniería Electrónica, Ingeniería Energética, Ingeniería Industrial, Ingeniería Hidráulica e Ingeniería Mecánica.

La difusión e intercambio de la labor científica contribuyen también los eventos internacionales que se realizan periódicamente en el Centro sobre temáticas que mantienen un seguimiento con positivos resultados, entre las que se encuentran: la enseñanza de la ingeniería y la arquitectura, enseñanza de la matemática y la física para ingenieros y arquitectos; ingeniería medio ambiental; manejo de los recursos hídricos; desarrollo de la arquitectura, ingeniería de materiales; gestión de la calidad; logística; bioingeniería; alta tensión; ecomateriales y gestión de recursos humanos, por citar algunos.

Bajo la premisa de fortalecer los procesos de enseñanza-aprendizaje desde la integración de las TIC, un propósito fundamental de la CUJAE, lo constituye lograr la mayor armonía posible y complementariedad entre la didáctica de los ambientes presenciales con la  de los ambientes virtuales en la formación de nuestros estudiantes.

La Universidad desarrolla diferentes acciones en el área de la teleformación, fundamentalmente en el pregrado, donde todas las facultades y carreras, han creado espacios importantes de intercambios con sus estudiantes. También desde el postgrado se vienen desarrollando acciones que cada día cobran una mayor significación, destacándose en este sentido el Centro de Referencia para la Educación de Avanzada (CREA).

Este centro, fundado en 1998 para cumplir con su misión, hace énfasis en la aplicación de las tecnologías de la información y la comunicación en la Educación Superior”.

El centro desarrolla hoy de manera exitosa sus actividades de postgrado en tres direcciones: los cursos de superación, pasantías y diplomados, maestrías y doctorados y postdoctorados. En cada una de ellos tiene una variada oferta orientada a cubrir la demanda de la Cujae y del territorio en que se enclava.

La formación de esos recursos humanos y los estudios avanzados se concretan en diferentes productos educativos, destacándose principalmente la maestría: “Las tecnologías en los procesos educativos”; el doctorado en Ciencias Pedagógicas y Ciencias de la Educación; cursos, pasantías y diplomados como: “Transformaciones en la Educación Superior a partir del impacto de las TIC”, “El proceso de enseñanza –aprendizaje en entornos virtuales”, “Los dispositivos móviles y su impacto en la Educación Superior”, “La transformación curricular en las instituciones de Educación Superior”, “Pedagogía y didáctica para la transformación educativa”, “Gestión de la información científica”, entre otros. 

Además de esto el centro potencia el desarrollo de proyectos de investigación; la colaboración internacional con prestigiosas Universidades de España, Perú, Brasil, Angola y Ecuador; es responsable del Congreso Internacional de Educación en Ingeniería y Arquitectura (CIEIA) en el marco de la Convención Científica de Ingeniería y Arquitectura que auspicia la Cujae cada 2 años; así como responsable del Taller Internacional Didáctica de las Ciencias Básicas, Ingeniería y Arquitectura que auspicia el Congreso Internacional Universidad cada 2 años. Además edita la revista electrónica Referencia Pedagógica indexada en bases de datos de alta visibilidad internacional como DOAJ y Latindex.