El Centro de Investigaciones Hidráulicas (CIH), desde su fundación en 1969, ha venido acumulando experiencia, prestigio nacional y reconocimiento internacional mediante numerosas aplicaciones y logros que están al servicio del país y dan reconocimiento a la Cujae. Actualmente, es el único centro de investigaciones en las ramas de la hidráulica en Cuba, donde la docencia y la investigación marchan de forma paralela.

Misión: Satisfacer la formación integral y continua de profesionales comprometidos con su Patria y sus deberes internacionalistas, así como la actividad científica en ramas de la Ingeniería Hidráulica y la extensión universitaria, teniendo en cuenta el liderazgo nacional y el reconocimiento internacional para contribuir con el desarrollo sostenible de la sociedad.